日本明治維新時代，西化的成果之一，就是教會進入日本民間。其中美國、英國及加拿大的聖公會在日本宣教，建立許多教區，從而日本成為世界聖公宗的一個教省（原則上一個國家是一個教省）。日本聖公會的宣教在十九世紀初期到達台灣，較之長老教會差會宣教晚了些，但也在台灣南北建立了教會。

二次大戰後，日本聖公會教會人員撤離，因無台籍聖公會神職人員管理教會財產，於是教會就由長老教會牧師提出使用，接收了教堂，即今台北市中山長老教會會堂和台南南門長老教會會堂。日本聖公會雖徹回本國，但尚未撤除教權，因而在1954年之前，台灣一直屬於日本聖公會教區。雖然如此，不論是台灣本地的聖公會會友或大陸遷台的聖公會牧師及信徒，卻無本會宗的教堂可聚會，而分散在其他教派的教會崇拜。

台海戰事爆發後，美國第七艦隊協防台灣，大量美軍及其眷屬駐台。這些美國人中，有一些是美國聖公會的信徒，他們覺得在台灣應該有自己的聚會場所，因他們的崇拜儀式不同於一般改革宗派的聚會形式。經過世界聖公宗協調，日本撤除對台灣地區的教權，1953年由美國夏威夷主教甘乃迪來台灣視察後，被美國總會派其來台設立台灣教區，成為美國西岸教省的一個教區。

台灣聖公會在1954年從零開始，錯過台灣教會發展的黃金十年（1945-1955），真是篳路藍縷，創業維艱。在沒有任何牧師傳道人的情況下，聖職人員由公務員或軍中的退伍人員找起，這些人都是擔任涉外翻譯等工作的軍公教人員。聖公會將這些信徒送到台南神學院接受裝備，畢業後開始在台灣拓殖教會。因而在改革宗教會中，既沒有台灣本土原來的教會系統，也沒有大陸遷台教會的資源，聖公會一步一腳印的宣教拓殖，建立教會。

因著早期教會合一運動，台灣聖公會和台灣長老教會有密切合作。1960年代，在美國聖公會教省協助下，於台南神學院興建兩座大樓，充實設備。同時訓練了不少台灣本地的教會領袖，長老教會也有願意加入聖公會的信徒，在南神接受裝備，畢業後在台灣南部開始牧會，這時是台灣聖公會聖職人員本土化的開始。

台灣聖公會屬於美國第八教省，美國第八教省是北從阿拉斯加州，到太平洋沿岸如加州，直延伸到夏威夷州。台灣聖公會開始之初，是屬於美國海外傳道區，由夏威夷教區派選主教。之後才成立美國聖公會海外教區，可獨立選主教。1965年有了第一任台灣聖公會主教。

依照聖公會的規定，四個教區才能成立一個教省（原則一個教省就代表一個國家，但如美國太多教區，幅員廣大，固有九個教省），但南韓和香港因情況特殊，經過向全球安立甘宗團契申請，以三個教區就能成為一個教省。台灣如果要成為獨立教省，就至少必須有三個教區，每個教區至少要有六個牧區，即至少要有六間教會，每間教會至少有四十位領聖餐的會友。台灣聖公會目前的計畫，是十年內成立兩個牧區，一個教區至少要有二三十個牧區。這是台灣聖公會的拓殖計畫，期望能發展到北、中、南三個教區，然後才有機會成立獨立的教省。

全球聖公會尊崇坎特伯里大主教為精神領袖，各地聖公會獨立運作，彼此尊重。不管教區教省大小，每個聖公會教區都是平等的。故台灣聖公會與美國聖公會的教區是平等，與其他國家也是如此。除了名義上，台灣聖公會已是相當獨立的教區了。